До складу інституту входять:
1. Кафедри● ДВЗУ та ТЕ (Двигуни внутрішнього згорання, установки та технічна експлуатація); ● ЕСЕУ та ТЕ (експлуатації суднових енергетичних установок та теплоенергетики);● ІМ та ТМ (інженерної механіки та технології машинобудування); ● К і Р (кондиціювання та рефрижерації)● ТТ і СПУ (технічної теплофізики і суднових паровиробних установок) ● Турбін
2. Центри● ННЦМІ (Навчально-науковий центр морської інфраструктури) з підрозділом ЦПДвЕ (Центр прикладних досліджень в енергетиці)